产品优势

1、酶转化 Zuì大限度降低 DNA 损坏，超低 DNA 起始量要求，低至 10ng；

2、卓越的比对率，GC 均一性；

3、高灵敏度，分辨率可达到单个碱基；

4、相比亚硫酸氢盐方法检 Cè  可多检  Cè 15% 的甲基化位点；

5、灵活适用不同靶向区域。

目录化产品

人（hg38）的 134Mb 设计长度（覆盖约 400 万 CpG 位点），基于新的 UCSC, Ensembl, ENCODE 等新的数据库，关注那些已知甲基化可影响基因调节的区域：57% CpG open seas (interCGI), 21% CpG island shores, 15% CpG islands, 8% CpG island shelves。

▲图。EM-seq 转化涉及一系列酶反应，以识别未甲基化胞嘧啶。

在 Dì 一次反应期 间，10-11 易位双加氧酶 2(TET2) 将甲基 化胞嘧啶（5mC 和 5hmC）转化为 5 - 羧基 胞嘧啶（5caC) 以及氧化增强剂葡糖苷 酸 5hmC(5ghmC)。这些反应保护 5mC 和 5hmC 免受下游脱氨作用。然后，在 APOBEC 将胞嘧啶脱氨至尿嘧啶之前， 使 DNA 变性。随后的聚合酶链式反应 (PCR) 扩增将修饰的 5mC 或 5hmC 转化 为胞嘧啶，并将尿嘧啶转化为胸腺嘧啶。PCR 后，核酸序列与重亚硫酸盐转化的 序列一致，使得 EM-seq 与现有分析流程 （如 Bismark 和 bwa-meth）相兼容。

酶法的高效转化

在 EM-seq 和 BS-seq 中，酶和亚硫酸氢盐都是将未甲基化的胞嘧啶转化为胸腺嘧啶，且转化效率接近。选择 CpG 甲基化的 pUC19 DNA 和未甲基化的 Lambda DNA 这种已知甲基化 DNA 作为质控对象，结果显示，两种文库转换方法的转化率均达到 99.5%，以胞嘧啶在非 CpG 位点转化为胸腺嘧啶的百分比来测量。

伯豪生物客户项目发文