JJ Red和JJ Green是百萤生物自主研发的核酸染料，JJ Green是一种结合于所有dsDNA双螺旋的具有红色/绿色激发波长的染料，它是Gel Red/Green、SYBR、EB核酸染料的替代品。今天小萤为大家带来的是这种核酸染料的相关问题解答。
1.在使用该染料进行凝胶电泳时，Marker分辨率低的主要原因是什么？
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答：①Marker的加样量：marker有一个推荐浓度范围，选择高的，样品与Marker含量差别大, 也会造成条带错误（这不会是染料的问题，用EB也会存在该问题）。正确的DNA上样量是条带清晰的保证。Marker应该选择在目标片段大小附近的梯带较密的，这样比对才准确。另外注意的是，Marker的电泳条件也要符合DNA电泳的操作标准: 如果选择λDNA/EcoR I的酶切marker，需要预先65℃加热5min，冰上冷却后使用。从而避免Hind Ⅲ或EcoR I酶切造成的粘性接头导致的片段连接不规则或条带信号弱等现象。 ②凝胶不平整：梳子不干净有污染，加样孔不平整也会影响图的效果； ③电泳条件：电压不稳，电泳时间不超过1h。电压过高，会导致小片段跑出胶，出现条带缺失现象。 ④缓冲液：TBE的缓冲能力更强，如果缓冲液缓冲性能下降，会导致DNA电泳条带模糊，不规则迁移等。TAE建议换成TBE效果更好。另外建议配胶时的缓冲液和电泳缓冲液是同时配制。 ④染色剂：JJ Red是高灵敏的DNA荧光染料，适用于各种电泳分析，操作简单：无须脱色或冲洗。至少可检出20pg DNA，高于EB染色法25-100倍。JJ Red 与dsDNA 结合荧光信号会增强800-1000倍，用JJ Red染色的凝胶样品荧光信号强，背景信号低。可适用于多种电泳分析。注意观察凝胶时应根据染料不同，使用合适的光源和激发波长，如果激发波长不对，条带会出现模糊等情况。 |
2.在JJ Red / JJ Green性如何？
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答：JJ Red / JJ Green已经被证明是替代EB、Gel、SYBR染料更为的产品。不过，请使用这些试剂时，也要遵循实验室条例等。 |
3.JJ Red / JJ Green的结合机制是什么？
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答：JJ Red/ JJ Green作用原理通过静电及电荷相互作用的结合。 |
4.JJ Red / JJ Green检测下限是什么？
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答：JJ Red/ JJ Green是超敏感的染料，至少可检出20pg DNA。然而，染色的灵敏度取决于仪器的性能和曝光设置等。 |
5.可以重新融化JJ Red / JJ Green凝胶，再制备吗？
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答：可以，但好再添加一些染料，保证重新制备凝胶的信号强度。 |
6.可以提前制作JJ Red / JJ Green凝胶，储存供以后使用吗？
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答：JJ Red和JJ Green染料是稳定的。在保证琼脂糖凝胶的完整性不会被破坏的前提下，你可以将预制的JJ Red / JJ Green凝胶储存供以后使用。我们建议在2-8℃避光贮存凝胶。 |
7.用哪些仪器检测JJ Red和JJ Green？
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答：JJ Red兼容紫外透射仪和蓝光透射仪，以及基于汞弧灯和氩离子激光的凝胶扫描仪。JJ Green可使用300 nm紫外透射仪检测。 |
8.JJ Red和JJ Green可以用来染色单链DNA或RNA吗？
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答：JJ Red和JJ Green可用于单链DNA和RNA的染色，但JJ Red染单链核酸效果比JJ Green敏感5倍左右。使用荧光酶标仪的滴定实验表明，JJ Red结合单链DNA和RNA荧光信号约是结合双链DNA的一半左右。 |