多肽组学是研究生物体内多肽分子的组成、功能及其相互作用的学科。作为蛋白质组学的一个重要分支，多肽组学不仅关注多肽在细胞内的合成、修饰及其生物学功能，还探索其在生理和病理状态下的变化。多肽在机体的免疫、内分泌、消化以及神经系统等多个关键生物过程中的重要作用，使其成为现代生物学研究的热点。通过深入解析多肽组学，科学家能够发现新的生物标志物并为疾病的早期诊断和治疗提供更加精准的工具。随着质谱技术的不断发展，多肽组学的研究正逐渐揭示更多生物学和医学中的潜力，推动着生命科学的前沿探索。
北京百泰派克生物科技依托先进的质谱平台，专注于多肽组学及其相关领域的深入研究。我们致力于为科研工作者提供全新的研究视角，填补蛋白质组学与代谢组学之间的研究空白。通过我们的平台，您将获得精准的数据支持和技术保障，推动您的科研项目更进一步。现特展示我司部分项目的研究成果，期待与各位科研专家和学者展开深入合作与交流，共同推动生命科学领域的创新和发展。
1、大蜡蛾神经肽的基因组学、转录组学和肽组学及其响应铅胁迫的表达
图1
文献名称：Genomics, transcriptomics, and peptidomics of the greater wax moth Galleria mellonella neuropeptides and their expression in response to lead stress
发表期刊：Insect Science， Pub Date : 2023-09-09 , DOI: 10.1111/1744-7917.13264
研究背景：生物体利用多种机制来螯合、排泄和代谢重金属，以处理环境中的重金属流入，维持金属稳态。这些机制被认为与神经肽介导的复杂信号通路有关。
样本材料：大蜡蛾（Galleria mellonella）
技术方法：基因组学、转录组学、肽组学LC-MS。
主要成果：通过基因组和转录组对大蜡蛾（Galleria mellonella）中的神经肽进行了预测和注释，并通过LC-MS（百泰派克提供技术支持）直接检测了这些多肽，在本研究中，一共预测和注释了63和67个神经肽前体，其中40个神经肽前体在大蜡蛾的基因组和转录组中得到证实。另外发现12个神经肽前体基因存在于大黄蜂中，而在蜜蜂中不存在，这可能是潜在的新的农药靶点。研究通过转录组测序分析Pb胁迫大蜡蛾神经肽F1的表达显著下调，进一步阐明神经肽如何调节大蜡蛾的生理功能、了解大蜡蛾的环境可塑性以及鉴定潜在的新的生物标志物来评估重金属对昆虫的毒性具有重要意义。
图2
2、栉江珧外套膜新型酪氨酸酶抑制肽的优化及其分子抑制机制
图3
文献名称：Optimization of a Novel Tyrosinase Inhibitory Peptide from Atrina pectinata Mantle and Its Molecular Inhibitory Mechanism.
发表期刊：Foods， Pub Date : 2023-10-24 , DOI: 10.3390/foods12213884
研究背景：为了实现海洋贝类资源的多层次利用，开发栉江珧加工副产品的潜在生物活性，从其外套膜提取了明胶并探讨了其酶解肽的潜在美白作用。
样本材料：栉江珧（Atrina pectinata）
技术方法：响应面优化栉江珧明胶肽(Atrina pectinata mantle gelatin peptide，APGP) 提取工艺、最优工艺条件制备多肽、多肽组学LC-MS、分子对接。
主要成果：以酪氨酸酶抑制活性为评价指标，采用响应面法对酶水解工艺进行优化，在最佳酶水解条件下(pH 5.82，238 min酶水解时间，温度为54.5℃)获得的APGP经超滤和LC-MS（百泰派克提供技术支持）进行分离，分子对接筛选4个新肽，其中Tyr-Tyr-Pro（YYP）对酪氨酸酶的抑制作用最强，半抑制浓度值（IC50）为1.764 ± 0.025 mM。分子对接结果表明，氢键是多肽YYP与酪氨酸酶相互作用的主要驱动力。这些结果表明，YYP可作为一种酪氨酸酶抑制剂广泛应用于美白食品和药物中。
图4
3、一种新型酪氨酸酶抑制肽的制备、鉴定及作用机理研究
图5
文献名称：A novel tyrosinase inhibitory peptide obtained from Sipunculus nudus gelatin hydrolysate: Preparation, identification, and action mechanism
发表期刊：LWT - Food Science and Technology , Pub Date : 2024-06-05 , DOI: 10.1016/j.lwt.2024.116293
研究背景：酪氨酸酶抑制肽（TIPs）因其具有良好的生物安全性和易吸收性，在食品、化妆品和制药等领域受到广泛关注。
样本材料：星虫（Sipunculus nudus）体壁中提取明胶
技术方法：响应面优化星虫明胶提取工艺、最优工艺条件制备多肽、多肽组学LC-MS、分子对接。
主要成果：本研究采用单因素实验和响应面优化的方法，制备了星虫明胶酶解产物(SNGH)。随后通过超滤分类、生物活性预测、分子对接、分子动力学模拟等方法筛选出一种新型酪氨酸酶抑制肽并对其抑制机制进行分析。结果表明，最佳酶解工艺为酶投加量为4768.87 U/g，酶解时间为4.72 h，酶解温度为42.76℃。在超滤组分I （SNGH-I）中共检测到287个具有高酪氨酸酶抑制活性的多肽（百泰派克提供技术支持），通过分子对接筛选出结合能<−7.0 kcal/mol的多肽161个。经生物活性筛选，获得91个生物活性评分>0.3的肽段。最后根据疏水性、多肽评分和分子量筛选出5种可能的TIPs。其中，IIAPPERKY、VWDESFKVF和FAGDDAPRAVFPS表现出较强的酪氨酸酶抑制活性。分子动力学模拟结果表明，IIAPPERKY具有较好的构象稳定性，属于可逆竞争性抑制剂。
图6
4、小麦肽通过激活 Keap1-Nrf2 信号通路维持肠道屏障的完整性来缓解 DSS 诱导的结肠炎
图7
文献名称：Wheat peptide alleviates DSS-induced colitis by activating the Keap1–Nrf2 signaling pathway and maintaining the integrity of the gut barrier
发表期刊：Food & Function, Pub Date : 2024-04-03 , DOI: 10.1039/d3fo04413k
研究背景：炎症性肠病（IBD）很难治愈，膳食肽具有有抗氧化、抗炎症和免疫调节等作用。
样本材料：不同剂量组的小麦肽（WP）喂养小鼠后收集盲肠内容物；小麦肽处理人肠上皮细胞（Caco-2 cell）。
技术方法：IHC、Elisa、RT‒qPCR、WB、肠道菌群16S rRNA测序、靶向代谢、分子对接、IF、多肽组学LC-MS及活性分析。
主要成果：本研究以葡聚糖硫酸钠（DSS）为基础建立小鼠结肠炎（UC）模型，评价饲粮中添加小麦多肽（WP）对结肠炎的预防效应，采用肠道菌群16S rRNA测序分析小麦多肽对肠道菌群的调节效应，探讨小麦多肽的潜在靶点；在WP中总共鉴定出313种肽，其中4种预计为生物活性肽（百泰派克提供技术支持），基于Caco-2 细胞验证了WP和四种生物活性肽对 Keap1-Nrf2 信号通路的调节作用。该研究表明WP 通过帮助维持肠道屏障完整性和靶向 Keap1-Nrf2 轴来减轻 DSS 诱导的结肠炎；这些结果为在饮食策略中添加 WP 来预防 IBD 提供了理论依据。
图8
5、从茶花籽饼中鉴定出一种新型 ACE 抑制性六肽及其稳定性评价
图9
文献名称：Identification of a Novel ACE Inhibitory Hexapeptide from Camellia Seed Cake and Evaluation of Its Stability.
发表期刊：Foods, Pub Date : 2023-01-21 , DOI: 10.3390/foods12030501
研究背景：植物源蛋白的茶花籽具有良好的营养价值，茶花籽饼蛋白（CP）能够在高血压等疾病治疗方面有较好的应用。
样本材料：酶解法得到具有抑制ACE（血管紧张素I转换酶）活性的CP水解产物。
技术方法：多肽组学LC-MS&活性肽段分子对接
主要成果：CP经中性蛋白酶水解4小时后的水解物对ACE抑制活性最高。然后通过超滤、Sephadex G-25 凝胶色谱分离、LC-MS（百泰派克提供技术支持）分析筛选获得具有 ACE 抑制活性的多肽VVVPQN。分子对接表明VVVPQN可以与ACE结合形成八个氢键；稳定性研究结果表明，VVVPQN在弱酸性和中性环境中保持较高的ACE抑制活性，热处理（20-80℃）和Na+、Mg2+以及Fe3+金属离子对其活性影响不大。此外，在体外模拟胃肠消化后仍保持相对稳定。这些结果表明，从山茶籽饼中鉴定出的 VVVPQN 具有应用于功能性食品或抗高血压药物的潜力。
图10
6、罗非鱼皮中两种新型细胞保护肽的分离、鉴定和计算机分析，以对抗氧化应激诱导的卵巢颗粒细胞损伤
图11
文献名称：Isolation, identification and in silico analysis of two novel cytoprotective peptides from tilapia skin against oxidative stress-induced ovarian granulosa cell damage
发表期刊：Journal of Functional Foods, Pub Date : 2023-06-21, DOI: 10.1016/j.jff.2023.105629.
研究背景：新型食品源生物活性肽的需求日益增加，研究发现罗非鱼（Oreochromis mossambicus）皮肤水解液显著改善了动物模型中卵巢颗粒细胞的凋亡，本研究想通过分离和鉴定水解液，以期拓宽开发营养食品的新视野。
样本材料：罗非鱼皮肤分别被胰蛋白酶、胃蛋白酶、中和酶、热蛋白酶和木瓜蛋白酶酶消化后的水解产物（TSP）处理卵巢颗粒细胞（KGN细胞）。
技术方法：多肽组学LC-MS & 活性肽段分子对接、细胞活性检测、WB。
主要成果：本研究分离并鉴定了罗非鱼皮酶解产物中的细胞保护肽（百泰派克提供技术支持）。通过计算机虚拟筛选策略人工合成筛选出具有潜在高生物活性的新型肽（APDPFRMY和NGGPDWAR），并通过氧化应激诱导的卵巢颗粒细胞模型验证其细胞保护活性。同时，分子对接和蛋白质印迹结果表明两种新型细胞保护肽可以通过氢键、静电相互作用和疏水相互作用与Keap1 Kelch结构域的关键残基相互作用，还发现APDPFRMY和NGGPDWAR可以部分占据Nrf2和Keap1的结合位点，从而起到保护细胞免受氧化损伤的作用。该研究也为分离和鉴定食品源生物活性肽提供了新思路。
图12
7、鲟鱼 (Acipenser schrenckii) 软骨抗炎肽的纯化与鉴定
图13
文献名称：Purification and identification of anti-inflammatory peptides from sturgeon (Acipenser schrenckii) cartilage
发表期刊：Food Science and Human Wellness, Pub Date : 2023-04-04 , DOI: 10.1016/j.fshw.2023.03.030
研究背景：早先的研究提出了从水产品软骨中生产具有免疫功能调节潜力的肽的可能性。本文旨在研究鲟鱼 (Acipenser Schrenckii）软骨中多肽对脂多糖（LPS）刺激的RAW264.7巨噬细胞的潜在抗炎活性。
样本材料：鲟鱼软骨的乙醇水解物。
技术方法：Elisa、多肽组学LC-MS、转录组学、WB。
主要结果：从可溶于乙醇的软骨水解物中鉴定出的五种生物肽（LC-MS，百泰派克提供技术支持）并进行活性研究。研究发现LTGP、LLLE、LLEL 和 VGPAGPAGP 减少了一氧化氮 (NO) 和白细胞介素 6 (IL-6) 的产生，同时增加白细胞介素10 (IL-10) 的排泄；转录组分析表明LLEL部分可以通过下调巨噬细胞中MAPK信号通路和iNOS的表达而表现出抗炎特性。这种新型肽为开发功能性食品提供了一种有吸引力的方法。
图14
8、Weizmannia coagulans 细胞外蛋白通过抑制致病细菌和调节TLR2/TRAF6 介导的 NF-κB 和 MAPKs 信号通路来减少皮肤痤疮
图15
文献名称：Weizmannia coagulans Extracellular Proteins Reduce Skin Acne by Inhibiting Pathogenic Bacteria and Regulating TLR2/TRAF6-Mediated NF-κB and MAPKs Signaling Pathways
发表期刊：Probiotics and Antimicrobial Proteins, Pub Date : 2023-10-23 , DOI: 10.1007/s12602-023-10175-2
研究背景：作为益生菌的Weizmannia coagulans (W. coagulans)常用于食品和药物中调节肠道菌群，发挥抗炎作用。
样本材料：W. coagulans YTCY 菌株的发酵液、痤疮杆菌和
的活性检测模型、人永生化角质形成细胞（HaCaT）模型、痤疮兔耳模型。
技术方法：多肽组学LC-MS、Elisa、生物活性检测、qPCR、WB、HE染色。
主要结果：从发酵液中提取分离的YTCY-EPs的主要成分是1.51~11.44 kDa的肽，约占80%。在LC/MS-MS（百泰派克提供技术支持）鉴定的肽中，YTCY_A-F具有抗菌肽特性，而YTCY_1-4具有抗氧化特性，能在体外通过调节NF-κB和AP-1的核转位来减少下游TLR2/NF-κB和MAPKs/AP-1通路；炎症细胞因子、炎症趋化因子和基质金属蛋白酶基因的转录表达也受到调节，从而减缓炎症细胞的募集和炎症的发展，并增加角质形成细胞的流动性；用YTCY-EPs检测的有痤疮问题的兔耳中炎症因子和基质金属蛋白酶的表达水平显着降低，明显观察到兔耳炎症、痤疮和角化问题得到修复。本研究结果证明YTCY-EPs可以作为化妆品中潜在的抗痤疮原料。
图16
9、茶花籽饼酶解新型α-葡萄糖苷酶抑制肽的优化及分子机制研究
图17
文献名称：Optimization and Molecular Mechanism of Novel α-Glucosidase Inhibitory Peptides Derived from Camellia Seed Cake through Enzymatic Hydrolysis.
发表期刊：Foods, Pub Date : 2023-01-13 , DOI: 10.3390/foods12020393
研究背景：近年来，食源性降糖肽在活性肽的研究中备受关注但其抗糖尿病作用机制尚不明确。本研究利用山茶籽饼蛋白（CSCP）制备具有α-葡萄糖苷酶抑制作用的活性肽。
样本材料：山茶籽饼蛋白的水解肽。
技术方法：多肽组学LC-MS & 活性肽段分子对接。
主要成果：山茶籽饼蛋白水解肽（CSCPH）在最优条件下获得的水解物对α-葡萄糖苷酶的抑制率最高。通过超滤和 Sephadex G25 从 CSCPH中分离鉴定（百泰派克提供技术支持）出具有高 α-葡萄糖苷酶抑制活性的肽。通过抑制动力学分析和分子对接分析了LLVLYYEY和LLLLPSYSEF对α-葡萄糖苷酶的非竞争性抑制关系；进行模拟胃肠消化（SGID）这两种新型α-葡萄糖苷酶抑制肽对SGID具有较高的抗性。该研究表明使用山茶籽饼中的肽作为降血糖化合物来预防和治疗糖尿病的可能性。
图18
10、鹰嘴豆蛋白组分对消化过程中α-淀粉酶活性的影响
图19
文献名称：Effects of chickpea protein fractions on α-amylase activity in digestion
发表期刊：Food Hydrocolloids, Pub Date : 2022-07-31 , DOI: 10.1016/j.foodhyd.2022.108005
研究背景：淀粉有助于预防和改善糖尿病、胃肠道癌症、肥胖等症状，但是人体内源性蛋白对淀粉的消化相对较弱。本项目研究了鹰嘴豆中内源性蛋白质对淀粉消化动力学的影响。
样本材料：多种鹰嘴豆(Cicer arietinum L.)种子中提取内源性白蛋白、球蛋白和谷蛋白，并用胃蛋白酶和猪胰腺α-淀粉酶（PPA）模拟消化得到酶切液。
技术方法：多肽组学LC-MS & 活性肽段分子对接
主要成果：本研究项目从鹰嘴豆中提取水解产物，鉴定了属于白蛋白、球蛋白和谷蛋白小肽的潜在蛋白质 α-淀粉酶抑制剂 (α-AI)（百泰派克提供技术支持），并探索了它们与 PPA 的结合机制。研究发现，蒸煮和胃蛋白酶水解导致蛋白质组分严重降解，其中<3 kDa的肽表现出很强的抑制活性（高达50%）。使用LC-MS鉴定了对PPA抑制活性最强的<3 kDa 的组分，并通过对接结果表明谷蛋白可以产生最多的 α-AI（45 个肽），其次是球蛋白（41）和白蛋白（12），其中，预计71种肽通过与 PPA 中的柔性环和三个主要催化残基结合来抑制酶活性；而 6 种肽通过与 PPA 的非催化区域相互作用来抑制酶活性。因此，不同的抑制类型可以共同阻碍酶-淀粉复合物的形成，从而抑制PPA活性，降低淀粉消化率。
图20
11、基于代谢组学分析蛋清蛋白水解物改善败血症引起的肾脏和肝脏炎症损伤
图21
文献名称：Egg white protein hydrolysate ameliorated sepsis-induced inflammatory injuries in kidney and liver based on metabolomics analysis.
发表期刊：Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie, Pub Date : 2022-07-22 , DOI: 10.1016/j.biopha.2022.113442
研究背景：感染引起的脓毒症可诱发全身炎症和各种器官损害，从鸡蛋中获取的生物肽可能被当做食疗的一种治疗手段。
样本材料：热稳定酶水解鸡蛋清后分离＜3kDa的肽段处理脂多糖(LPS)大鼠。
技术方法：Elisa、多肽组学LC-MS 、代谢组学、HE。
主要成果：用LC-MS（百泰派克提供技术支持）对鸡蛋清酶解后的肽段（PEP）成分进行定性，并研究这些肽段处理LPS大鼠后的理化性质。血细胞计数、促炎细胞因子（TNF-α 和 IL-6）、BUN 和 Cr 水平以及组织或血清中的病理损伤的结果表明PEP 减轻了 LPS 诱导的损伤；使用 UPLC-MS/MS 对PEP的血清代谢物进行分析和鉴定，发现PEP显著改变了血清中83种代谢物的水平，主要参与氨基酸代谢、氧化应激和能量代谢。结果表明，PEP改善了LPS诱导的急性肝肾损伤，有助于进一步的开发和研究。
图22
12、从榛子蛋白中筛选抗氧化肽的新见解：基于氨基酸残基的性质
图23
文献名称：A Novel Insight into Screening for Antioxidant Peptides from Hazelnut Protein: Based on the Properties of Amino Acid Residues
发表期刊：Antioxidants Pub Date : 2022-01-07 , DOI: 10.3390/antiox11010127
研究背景：作为木本油生产的主要副产品，榛子蛋白由于其潜在的致敏性，通常被用作动物饲料或土壤肥料。根据蛋白氨基酸残基的特性从榛子蛋白中筛选出抑制亚油酸氧化的抗氧化肽。
样本材料：榛子蛋白水解及其他合成肽。
技术方法：Elisa、多肽组学LC-MS。
主要成果：本研究利用氨基酸残基的特性从榛子蛋白中筛选抗氧化肽。通过对合成二肽的信息和BIOPEP数据库的分析，证实了氨基酸残基的类型和位置、亲水性的总平均值和肽的分子量可以综合应用于获得理想的抗氧化剂。结果表明，从榛子蛋白水解物中鉴定出六种肽 FSEY、QIESW、SEGFEW、IDLGTTY、GEGFFEM 和 NLNQCQRYM，其抗亚油酸氧化的抗氧化能力高于还原型谷胱甘肽 (GSH)。发现在C末端具有 Tyr 残基的肽比其他肽更能抑制亚油酸的氧化。本研究提供了这种通过氨基酸残基的特性从榛子蛋白中挖掘抗氧化肽的新方法。
图24
结语：
综合发表的文献来看，当前的多肽组学研究主要集中在生物活性肽(Biologically active peptides or bioactive peptides)领域，这些肽类分子在调节生理功能和预防疾病方面展现出显著的潜力。例如第三篇的酪氨酸酶抑制肽、第四篇的抗炎肽、第五篇的ACE抑制性六肽等。
活性肽的来源多样，可能是粮食作物（小麦肽、大豆蛋白肽）、动物乳汁（牛奶、羊奶）、海洋或水产品（罗非鱼皮、鲟鱼软骨）以及作物的副产品（茶花籽饼）等。这些研究无疑给不同食品原料的高价值开发以及副产物的再利用提供了理论支持，也符合国家大食物观发展观念。另一个方面来看，由于活性肽本身的性质和食品源性，基本不会在身体组织中积累，不会产生严重的副作用，因此在预防和治疗某些疾病方面，它们是传统药物的更好替代品。与小分子药物相比，活性肽治疗具有更高的选择性、特异性和有效性，因此成为多肽领域的研究热点也理所当然。
传统的活性肽筛选研究中，需要对样本进行超滤、层析和液相分级，通过实验不断缩小范围，而后对活性最高的组分进行质谱鉴定和虚拟筛选，最后进行合成验证，并通过分子对接解析互作机制。层析与液相的方法整体耗时较长、成本偏高且不断不验证缩小范围的步骤繁琐。机器学习的方法则可以帮助省略这个过程。
百泰派克生物科技针对不同活性类型，一对一构建模型，进行预测，构建了抗菌、抗氧化、抗炎、抗血压、抗血糖、致敏性、潜在毒性、鲜味肽和苦味肽模型，预测准确率基本可达80%以上，部分可达90%以上。提供分子对接结合能计算（虚拟筛选）以及结合构象图、2D相互作用图和3D相互作用图绘制服务，打造活性肽研究全流程平台！作为生物质谱领域的先行者，百泰派克生物科技拥有专业的技术团队和7大质量控制检测平台，获国家CNAS实验室认可，为广大科研工作者提供一站式多肽组学分析服务，帮助科研人员更直观地理解活性肽的作用机制与分子互作模式，欢迎随时与我们技术支持沟通~
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