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干货来袭|液体活检,你真的了解吗?

作者:菁良科技(深圳)有限公司 2020-05-08T10:41 (访问量:4694)

基因检测的应用变革了整个肿瘤的诊断和治疗格局,已经成为肿瘤诊疗中必不可少的关键步骤。相比组织

活检的局限性,循环肿瘤 DNA(ctDNA)创造了更多的非侵入式诊断、治疗和监测的可能性。

 

含义和特性

ctDNA 是从肿瘤细胞脱落的游离 DNA(cfDNA),由肿瘤细胞分泌或细胞死亡后释放入血。ctDNA 是小片段 DNA,通常少于 200 个核苷酸。循环中 ctDNA 存在时间很短,半衰期仅有 2 小时。

ctDNA 具有体细胞突变,借此和其他 cfDNA 得以区分。

 


ctDNA检测的优点

1、不需要侵入性步骤,避免了组织活检的风险和取样不足问题;

2、肿瘤具有时空异质性,组织活检只能给出某一时间点某一部分的「快照」;ctDNA 来自于所有部位的肿瘤,可能更准确地反映整个肿瘤全貌;

3、半衰期短,可以作为追踪几小时内治疗反应的动态工具。


ctDNA检测的缺点

1、肿瘤负荷较小时,不能敏感检测到微量的 DNA 变异;

2、不稳定,分析前有降解可能。

 

检测方法

由于 ctDNA 含量很少,所以需要高度敏感的检测手段。常用的检测技术包括测序和数字 PCR(dPCR)。

测序可以分析特定靶点乃至全外显子或基因组数据,可以同时检测多种突变。dPCR 检测含量可达到0.01%。虽然敏感性和特异性都高,但一次只有一种探针,检测效率受到突变数量影响。


ctDNA检测在临床中的应用

预后价值

ctDNA 可以预测预后和治疗反应。ctDNA 含量和分期及肿瘤大小相关,进展期肿瘤的 ctDNA 是早期肿瘤的 10~100 倍,而具有高肿瘤负荷的患者预后不良,因此 ctDNA 可以测量疾病负荷和预后。

一项结肠癌术后检测 ctDNA 的研究中,可检测到 ctDNA 的患者 2 年 RFS 率是 48%,而未检测到的患者是 100%。在预测复发上的敏感性和特异性是 100%。

 

分子分层,指导治疗

检测 ctDNA 中的 EGFR 突变已经用于非小细胞肺癌的临床。中国学者主持的 BENEFIT 研究是一项 ctDNA 为基础的 EGFR 分析指导 EGFR TKI 治疗的前瞻性研究。研究发现血检和组织学检测的一致性高,可以弥补组织学的不足。

而且在治疗有效时,ctDNA 水平下降,有助于早期判断疗效。虽然特异性高,但是 ctDNA 检测仅具有中度敏感性,含量太少时可能造成假阴性,这时候需要组织活检确认。


早期发现肿瘤耐药复发

很多研究表明肿瘤对治疗有反应时,ctDNA 水平降低,而疾病进展时又再度升高,因此可以提前于影像学发现肿瘤复发,有可能创造在临床进展前改变治疗方案的机会。但是还没有证据支持在 ctDNA 进展而无临床进展时改变治疗的策略可以改善结局。此外,一些研究表明 ctDNA 反应并不一定总和影像学反应平行。

 

肿瘤筛查

近期研究表明,联合蛋白质和 cfDNA 筛查肿瘤,筛查出 II 期肿瘤的敏感性为 73%,I 期肿瘤敏感性为 49%,而特异性>90%。但是循环基因变异还可能来自于转化过程初期细胞,可能在临床上并没有重要意义。ctDNA 筛查的假阳性范围还难以界定,因此可能会带来过度诊断的问题。

ctDNA 检测方便而灵活,在肿瘤诊疗的众多领域中都具有巨大潜力。这个血液中的小小肿瘤指纹,有望开创新的分子病理学范例,通过精准肿瘤学而改变癌症治疗的未来。

 

菁良基因ctDNA标准品

产品特点

▪产品包含套装形式,可以测低至0.1%的LOD

▪验证常见的热门基因突变位点及突变形式

▪产品平均片段分布在160bp左右:最大程度接近真实血浆ctDN**段分布

▪细胞来源标准品,最大程度模拟患者样本

▪所有位点的AF皆通过ddPCR验证

 

产品应用


 

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